馬家灣自然科學(xué)院舊址位于延安市寶塔區(qū)橋溝鎮(zhèn)馬家灣村北大修廠院內(nèi)。
自然科學(xué)院的前身是自然科學(xué)研究院。1939年5月,為了保證陜甘寧邊區(qū)工業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展,促進(jìn)同防、經(jīng)濟(jì)建設(shè),中共中央決定在延安創(chuàng)辦自然科學(xué)研究院。1939年底,在中央財(cái)經(jīng)部召開的自然科學(xué)討論會(huì)上,一些專家學(xué)者提出以現(xiàn)有的科技人員為師資,自然科學(xué)研究院為基地,成立自然科學(xué)研究院。1940年1月,中共中央決定將自然科學(xué)研究院改為工、農(nóng)、科性質(zhì)的教育機(jī)構(gòu)——自然科學(xué)院。院長(zhǎng)由李富春兼任,副院長(zhǎng)陳康白,學(xué)院屬中央財(cái)經(jīng)部領(lǐng)導(dǎo)。1940年9月1日,自然科學(xué)院舉行開學(xué)典禮。1941年1月,學(xué)院改屬中央文委領(lǐng)導(dǎo),徐特立接任院長(zhǎng)。1941年9月,又開辦了醫(yī)訓(xùn)班,一年半后轉(zhuǎn)入醫(yī)科大學(xué)。1941年12月年底,中央規(guī)定:“延安大學(xué)、魯迅藝術(shù)學(xué)院、自然科學(xué)院為培養(yǎng)黨與非黨的各級(jí)高級(jí)與中級(jí)專門的政治、文化、科學(xué)及技術(shù)人才的學(xué)校!1943年10月,學(xué)院從馬家灣遷到東川橋兒溝,與延安大學(xué)、魯藝正式合并,成為延安大學(xué)的一個(gè)學(xué)院。
1945年8月,抗戰(zhàn)勝利后,中共中央決定將自然科學(xué)院向東北地區(qū)轉(zhuǎn)移。11月15日,自然科學(xué)院從延安出發(fā)。到張家口后,由于形勢(shì)變化,決定暫留當(dāng)?shù),改名為晉察冀邊區(qū)工業(yè)專門學(xué)校。1948年,與北方大學(xué)工學(xué)院合并,定名為華北大學(xué)工學(xué)院。1949年遷到北京。1952年1月1日,改稱北京工業(yè)學(xué)院(今北京理工大學(xué))。